Екосистеми в природі (водойми, річки, моря) мають здатність самоочищатись. Дана властивість і стала основою біологічного очищення побутових стічних вод. Побутові стічні води очищуються аналогічним способом, але в коротші терміни.
Для самоочищення екосистем в природі необхідні три умови:
НАЯВНІСТЬ КИСНЮ В ВОДІ. Забруднена вода в водоймі чи річці збагачується киснем через власну поверхню. Інтенсивність збагачення води киснем збільшується прямо пропорційно швидкості течії води.
ОПТИМАЛЬНА ТЕМПЕРАТУРА. Підвищення температури води зменшує кількість кисню і пришвидшує біологічну діяльність мікроорганізмів. Якщо температура є дуже низькою – процес самоочищення також практично зупиняється.
АКТИВНІ МІКРООРГАНІЗМИ. Мікроорганізми – важлива складова процесу самоочищення, оскільки вони живляться органічним забрудненням.
Якщо провести аналогію з біологічним принципом очищення побутових стічних вод – в станції очищення мікроорганізми живляться стічною водою, для їх активної біологічної діяльності створюється оптимальна температура і, оскільки існуючі умови не дозволяють воді збагачуватись киснем природним способом – кисень подається додатково. Сама система налаштована таким чином, що азот та фосфор у стічній воді відділяється природним біологічним шляхом.